Analyse 3
La présence d'une erreur systématique dans un test HTS peut être identifiée et visualisée en utilisant sa surface de distribution (Kevorkov et Makarenkov 2005, Makarenkov et al., 2007). En effet, une surface peut être calculée en déterminant le nombre de hits sélectionnés pour chaque emplacement de puits. Dans le cas idéal où l'erreur systématique est absente, on s'attend à ce que les hits soient uniformément répartis sur les emplacements des puits. Pour ce faire, et à l’aide de logiciel « HTS corrector » j’ai déterminé les valeurs numériques des distributions des données MacMaster avant et après la correction (Figure.8 ) que me servit par la suite de tracer à l’aide d’Excel leur surface polynomiale du quatrième degré (Figures.9 ).
Figure.8. visualisation des valeurs numériques des distributions avec seuils de sélection µ-1σ par puits pour les donnée de McMaster (1250 plaques) (a) : donnée brutes ; (b) Approx. Background Substraction; (c) Background Substraction ; (d) B score ; (e) median polish et (f) well correction