Analyse 4
Cette figure présente la distribution des Hits pour les données de McMaster avant et après la correction d’erreurs systémiques obtenues par sélection de hit avec seuils µ-1σ. D’où, le résultat montre clairement que les valeurs des hits, de méthode median polish, B score et Approx. Background Substraction n’est pas uniformément réparti. Quant à la méthode Background Substraction, elle est plus au moins homogène. Ainsi, la méthode de correction par puits, leurs valeurs des hits sont uniformément réparties. D’où il est clair que lors de la sélection des « hits », après l'utilisation des méthodes de correction il y a une amélioration des résultats, la méthode de correction par puits obtenant de meilleurs résultats par rapport à celle par soustraction de l'arrière-plan. Alors, que la correction par les méthodes B score et median polish ne sont pas performants.
La comparaison entre les différentes méthodes a montré que la méthode de correction par puits était plus performante que les autres méthodes, et ce dans diverses situations. Donc c’est clair qu'elle peut être appliquée dans la plupart des cas. Par ailleurs, B Score détecte parfaitement des erreurs sur une ou deux lignes (ou colonnes) par plaques, mais dans des conditions plus sévères (par exemple: erreurs possibles sur chaque ligne et chaque colonne des plateaux), elle se montre moins performante (Brideau et al., 2003). Quant à la correction par « median polish » que malgré l'avantage de gérer facilement les puits vides, qui sont fréquents dans la pratique du criblage à haut débit. Un des défauts de cette méthode, elle est sensible à la « randomisation» des échantillons dans les plateaux. (Brideau et al., 2003).
La comparaison entre les différentes méthodes a montré que la méthode de correction par puits était plus performante que les autres méthodes, et ce dans diverses situations. Donc c’est clair qu'elle peut être appliquée dans la plupart des cas. Par ailleurs, B Score détecte parfaitement des erreurs sur une ou deux lignes (ou colonnes) par plaques, mais dans des conditions plus sévères (par exemple: erreurs possibles sur chaque ligne et chaque colonne des plateaux), elle se montre moins performante (Brideau et al., 2003). Quant à la correction par « median polish » que malgré l'avantage de gérer facilement les puits vides, qui sont fréquents dans la pratique du criblage à haut débit. Un des défauts de cette méthode, elle est sensible à la « randomisation» des échantillons dans les plateaux. (Brideau et al., 2003).
Figure.9. La distribution des Hits (par une surface polynomiale du quatrième) avec seuils de sélection µ-1σ pour les donnée de McMaster (1250 plaques) (a) : donnée brutes ; (b) Background Substraction ; (c) Approx. Background Substraction ; (d) median polish; (e) B score et (f) well correction